על פי החלטת נשיאות המועצה המדעית מיום 08/01/2001 זכותם המלאה של המתמחות והמתמחים לבחור, בהתאם לסילבוס התמחותם, את הרוטציות אותן מעוניינים לבצע במהלך ההתמחות. בית החולים אינו יכול להכתיב אזיו רטציה לבחור מבין רשימת המקצועות בסילבוס ההתמחות וכן אינו רשאי להתנות או לעכב את יציאתם לרוטציה בתנאים כלשהן. יחד עם זאת, במידה ואותה רוטציה קיימת בבית חולים שבו מבצעים את ההתמחות, עליהם לבצע את הרוטציה שם, אלא אם כן קיבלו אישור ממנהל/ת המחלקה לצאת לבית חולים אחר.
אם אותה רוטציה אינה קיימת בבית חולים שבו מבוצעת ההתמחות, זכותם לבצעה במקום אחר.